Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK3P27448 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MARK3P27448 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MARK3P27448 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK3P27448 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms