Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLNP26678 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLNP26678 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLNP26678 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLNP26678 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLNP26678 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PLNP26678 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PLNP26678 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PLNP26678 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLNP26678 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLNP26678 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms