Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTX3P26022 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTX3P26022 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTX3P26022 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTX3P26022 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTX3P26022 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTX3P26022 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms