Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALB2P22676 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALB2P22676 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALB2P22676 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALB2P22676 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALB2P22676 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALB2P22676 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms