Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms