Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms