Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms