Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFE3P19532 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFE3P19532 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFE3P19532 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFE3P19532 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFE3P19532 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFE3P19532 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFE3P19532 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms