Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms