Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAV1P15498 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAV1P15498 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms