Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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