Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG2P13727 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG2P13727 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG2P13727 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms