Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT10P13645 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT10P13645 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT10P13645 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT10P13645 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT10P13645 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT10P13645 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT10P13645 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT10P13645 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms