Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms