Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms