Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IRF1P10914 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF1P10914 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF1P10914 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF1P10914 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF1P10914 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF1P10914 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms