Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms