Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms