Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00032P0C843 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms