Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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