Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP1P09874 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP1P09874 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARP1P09874 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARP1P09874 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARP1P09874 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARP1P09874 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP1P09874 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP1P09874 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP1P09874 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms