Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B1P05026 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms