Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFRP00533 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFRP00533 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms