Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN1O94985 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms