Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM2O94769 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECM2O94769 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM2O94769 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms