Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN15O75808 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms