Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPA1O75762 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms