Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms