Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM4AO75164 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms