Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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