Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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