Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTIFO43310 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTIFO43310 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTIFO43310 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTIFO43310 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTIFO43310 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTIFO43310 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTIFO43310 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTIFO43310 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTIFO43310 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms