Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF1O43189 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF1O43189 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF1O43189 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms