Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMBP2O15034 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms