Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT5O00445 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT5O00445 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT5O00445 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT5O00445 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT5O00445 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT5O00445 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT5O00445 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT5O00445 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT5O00445 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT5O00445 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT5O00445 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT5O00445 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT5O00445 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT5O00445 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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