Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DEV8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DEV8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms