Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms