Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL13PA6NNM8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms