Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms