Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms