Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms