Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms