Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF556-201ENST00000307635 6574 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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LAMA3Q16787 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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LAMA3Q16787 PLD5-208ENST00000536534 8721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 COL25A1-208ENST00000610288 4799 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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LAMA3Q16787 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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LAMA3Q16787 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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LAMA3Q16787 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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