Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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