Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PKHD1P08F94 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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