Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF300-202ENST00000394226 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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TRIM35Q9UPQ4 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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TRIM35Q9UPQ4 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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TRIM35Q9UPQ4 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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TRIM35Q9UPQ4 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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TRIM35Q9UPQ4 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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