Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms