Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms