Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC130365.1-201ENST00000530524 1553 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC024337.1-201ENST00000558860 1562 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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