Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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